全国治疗先天性短结肠比较好的三甲医院有1、三亚市中医院，2、四川省中西医结合医院，3、黑龙江省中医院，4、大连市中医医院，5、河南省中医院等，先天性短结肠属于儿科，三亚市中医院儿科疾病医疗设施齐全，在儿科疾病治疗方面有着丰富的经验；四川省中西医结合医院儿科口碑很好，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
第一名三亚市中医院儿科
三亚市中医院始建于1991年，是一所集医疗、教学、科研、保健、康复、传统医药国际交流与合作为一体的三级甲等中医医院。设职能科室19个，临床科室及医技科室35个，包括急诊、ICU、内、外、妇、儿、老年、骨伤、皮肤、男科、肛肠、针灸、推拿、康复、治未病、耳鼻喉科、口腔科、眼科、感染性疾病科、麻醉科、医学美容、影像、功能、检验、输血、中西药房等。其中国家临床重点专科1个（脾胃病科），国家中医重点专科2个（骨伤科、治未病中心），国家中医药管理局重点专科协作组单位3个（针灸科、临床药学、护理学），海南省重点专科1个（脑病专科）。
第二名四川省中西医结合医院儿科
四川省中西医结合医院是国家三级甲等公立医院，理、药剂等医技科室。拥有2个国家级重点学科（中医预防医学、肿瘤学），5个国家级重点专科（预防保健科、肿瘤科、肛肠科、妇科、耳鼻喉科），7个省级重点专科（专病）（肿瘤科、肛肠科、脾胃病科、骨伤科、皮肤科、颈部疲劳、高血压病），1个省级重大疾病防治中心（肿瘤防治中心），1个省级治未病中心（亚健康中心），8个院级重点专科（医疗美容科、针灸科、老年病科、心血管科、呼吸内科、神经内科、肾病内科、ICU，以其独有的中医特色和疗效，逐渐形成优势和影响力，为众多患者解除病痛。
第三名黑龙江省中医院儿科
我院的前身是成立于1957年的黑龙江省祖国医药研究所(俗称“祖研”)，现已发展成为我省规模最大的集医疗、科研和研究生教育于一体的综合性中医药机构，先后荣获“全省小康建设先进集体”和“全国卫生系统先进集体”的荣誉称号。随着规模的发展和功能的不断健全，2013年我院正式更名为黑龙江省中医药科学院。　　我院占地面积5万平方米，建筑面积8.5万平方米，分三个院区，现有人员1600多人，具有正、副高级职称专...
第四名大连市中医医院儿科
大连市中医医院成立于1961年，经过半个多世纪的励精图治，现已成为大连市具有较大规模，科室设置齐全，中医特色突出、教学实力强的集医疗、教学、科研、预防、保健、康复于一体的现代化综合性中医医院。也是大连市唯一以中医治疗为主、中西医并重的三级甲等医院。医院开放病床600张，在职职工659人,临床副主任医师以上近170人，博士3人，硕士64人，硕士生导师12人。开设了具有传统特色的脑病科、心血管病科、肺病科、消渴病病科、脾胃病科、肿瘤病科、肾病、男性病专科、骨伤科、外科、针灸科、推拿科、皮肤科、妇科、五官科、眼科、小儿科、乳腺病科、体检中心等30多个专科。
第五名河南省中医院儿科
河南省中医院（河南中医药大学第二附属医院）始建于1985年，是一所集医疗、教学、科研、预防、保健、康复为一体的现代化综合性三级甲等中医院；是省医保、市医保（含离休）、铁路医保（含离休）、省离休、城乡居民医保（原新农合）、省工伤医疗保险定点医疗机构，是河南省内异地就医、全国跨省异地就医首批试点医疗机构；为国家中医临床研究基地建设单位、全国首批中医全科医师培训基地、全国中医药适宜技术推广基地、全国中医药传承创新工程项目建设单位、国家区域中医（专科）诊疗中心建设单位、河南省中医（专科）诊疗中心建设单位。 [收起]