全国治疗子宫内膜异位症比较好的医院有1、北京协和医院，2、复旦大学附属妇产科医院，3、北京大学第三医院，4、华中科技大学同济医学院附属同济医院，5、浙江大学医学院附属妇产科医院等，子宫内膜异位症属于妇科，北京协和医院妇科疾病医疗设施齐全，在妇科疾病治疗方面有着丰富的经验；复旦大学附属妇产科医院妇科口碑很好，拥有完善的诊疗设施和医疗人员储备。
第一名北京协和医院妇科
北京协和医院是集医疗、教学、科研于一体的现代化综合三级甲等医院，是国家卫生健康委指定的全国疑难重症诊治指导中心，最早承担高干保健和外宾医疗任务的医院之一，也是高等医学教育和住院医师规范化培训国家级示范基地，临床医学研究和技术创新的国家级核心基地。以学科齐全、技术力量雄厚、特色专科突出、多学科综合优势强大享誉海内外。在复旦大学医院管理研究所公布的“中国医院排行榜”中连续十年名列榜首。
第二名复旦大学附属妇产科医院妇科
复旦大学附属妇产科医院，由沪上首家妇孺医院西门妇孺医院发展而来，因创建时屋顶呈红色，被广大市民以及患者亲切地称为"红房子医院"，医院设有妇科、产科、计划生育科、中西医结合科、新生儿科、宫颈疾病诊疗中心、乳腺科等多个临床科室及上海市中西医结合月经病诊疗中心、上海市女性生殖内分泌疾病诊疗中心、上海市集爱遗传与不育诊疗中心等多个专科诊疗中心。
第三名北京大学第三医院妇科
北京大学第三医院建于1958年，国家卫生健康委委管医院，集医疗、教学、科研、预防、康复与保健为一体的综合性三甲医院。2018年底，在岗职工5157人，开放床位1891张。医院有36个临床科室、10个医技科室。有27个博士点、1个临床博士后流动站。在岗博士生导师57人，中国科学院院士1人、中国工程院院士2人，国家千人计划1人，国家自然科学基金杰出青年基金获得者3人、科技部“973”首席科学家1人、教育部“长江学者特聘教授”2人，2人入选国家级“新世纪百千万人才工程”，青年千人计划1人，国家自然科学基金优秀青年科学基金获得者4人，卫生部突出贡献专家10人。
第四名华中科技大学同济医学院附属同济医院妇科
长江之滨，黄鹤楼下，有一所海内外闻名遐迩的医院，她就是华中科技大学同济医学院附属同济医院。同济医院1900年由德国医师埃里希.宝隆创建于上海。1955年迁至武汉。经过120年的建设与发展，如今已成为学科门类齐全、英才名医荟萃、师资力量雄厚、医疗技术精湛、诊疗设备先进、科研实力强大、管理方法科学的集医疗、教学、科研为一体的创新型现代化医院，其综合实力居国内医院前列。
第五名浙江大学医学院附属妇产科医院妇科
浙江大学医学院附属妇产科医院（浙江省妇女保健院、浙江省妇女医院）是浙江省妇产科医疗、教学、科研及计划生育、妇女保健工作的指导中心。三级甲等妇产科医院，设有妇科、妇科肿瘤科、产科、新生儿科、生殖内分泌科、计划生育科、妇女保健部、外科、内科、中医科、麻醉科、门急诊科等临床科室以及检验科、超声诊断科、放射科、病理科、药剂科、生殖遗传科等医技科室。拥有浙江省医学重点学科群1个（生殖医学）；浙江省医学重点学科7个，其中重点支撑学科4个（妇科肿瘤学、计划生育学、产科学、生殖内分泌学）、创新学科3个（妇科微创学、普通妇科学、围产护理学）。 [收起]