中医科成立于医院创建之际，经几代中医人数十年的努力与发展，科室学派纷呈，名医辈出，在绍兴及周边地区享有一定的声誉，现有在编临床医师6名，其中主任中医师1名，副主任中医师3名，硕士研究生2名。科室利用综合性医院的技术优势，衷中参西，扬长避短，除了在中医内科、中医妇科、中医儿科、中医骨伤科等常见病、多发病的诊治外，尚致力于运用中医中药，对各种肿瘤术后、化疗后、放疗后的康复治疗研究。
中医科为浙江省“示范中医科”创建科室。已在省级及以上杂志发表论文20余篇，并承办多个省、市级继续教育项目。
中医科中医内科：(1)消化系统疾病如功能性消不良、肠易激综合征，功能性便秘等功能性胃肠病，反流性食道炎、慢性胃炎、胆囊炎，胆石症;(2)呼吸系统疾病如上呼吸道感染、慢性咳嗽，支气管哮喘，咽喉炎，支气管炎，肺炎，慢性阻塞性肺病;(3)心血管系统疾病如病毒性心肌炎后室性早搏，冠心病，高血压,心脏神经官能症;(4)神经、精神系统疾病如中风及后遗症康复，眩晕症，糖尿病周围神经病变，血管性头痛，重型颅脑损伤术后，失眠症，慢性疲劳综合征;(5)泌尿生殖系如尿路感染，泌尿系结石，尿道不适综合征，慢性肾炎，性功能障碍等病证运用中医中药，诊治规范，疗效确切，受到病人好评。
中医科中医儿科：对儿科常见病如感冒，咳嗽，哮喘，疳积，腹泻，口疮，五迟等病证诊治经验丰富，疗效确切。
中医科中医妇科：对功能性子宫出血，原发性痛经，闭经，不孕证，盆腔炎，更年期综合征等疾病运用中医中药，诊治历史悠久，在绍兴地区有一定的影响。
中医科中医骨伤科：对常见病、多发病如四肢骨折，多处软组织挫伤，腰椎间盘突出，肩颈综合征等疾病运用中医中药，诊治规范，疗效显著。
中医科加强与兄弟临床科室合作，对中西医结合治疗阑尾脓肿，急腹症，术后康复等均有相当丰富的经验;目前与多科合作，中医中药为继手术，化疗，放疗，免疫等综合治疗肿瘤的又一大方法，主要运用在肺癌、乳腺癌，胃癌，直肠癌，肝癌等肿瘤康复治疗中，在一定程度提高了患者生活质量及生存期。
中医科研究方向：各种常见病证的中医药诊治规范；中医药对肿瘤放化疗后减毒增效的临床研究；对中晚期非小细胞肺癌的中医药疗效评价体系；腰椎间盘突出症的非手术治疗。
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